刺客信條II：探索

艾吉奧在尋找薩沃納羅拉的同時，也沒有忘記兄弟會的任務。1488年到1491年間，他前往佛羅倫斯，將有著「佛羅倫斯幽靈」之名的吉羅拉莫·達·路卡招募進了兄弟會。艾吉奧又在這一時期，結識了羅馬刺客盧卡斯·貝里尼。

1491年，艾吉奧收人通知，去威尼斯的盜賊公會找安東尼奧。趕到之後，艾吉奧看到安東尼奧身邊還有另一個人，名叫路易斯·德·聖坦傑爾。路易斯正要找一個「殺手」，請這位「殺手」去監視他朋友克里斯多福·哥倫布要去參加的會面。但艾吉奧表示沒有什麼興趣，打算回絕。但艾吉奧隨後得知，這場會面的另一方是羅德里戈·博吉亞。他立刻趕了過去，發現這場所謂的會面就是個純粹的圈套。但艾吉奧救下了哥倫布，得知羅德里戈對哥倫布的西行計畫深感興趣。之後，艾吉奧又去見了安東尼奧。安東尼奧讓他去花園區，路易斯和哥倫布想見他。兩人告訴艾吉奧，聖殿騎士奪走了他們繪製了探索航線的地圖。艾吉奧很快就取回了地圖，將地圖交還給了哥倫布與路易斯。路易斯把西班牙刺客兄弟會眼下的境況告訴了艾吉奧——西班牙宗教裁判庭的首席大法官託馬斯·德·託爾克馬達正下令逮捕他們。艾吉奧認為情況緊迫，只能暫擱奪回伊甸蘋果的任務，得知安東尼奧兩個線人的名字後，啟程前往西班牙。吉羅拉莫與盧卡斯等義大利刺客也同艾吉奧一起去了西班牙。

來到西班牙後，艾吉奧先是被盜賊偷走了劍，只能徑直去找安東尼奧的線人，讓他帶自己去當地的盜賊公會。抵達盜賊公會的艾吉奧卻發現，公會裡空無一人，只有準備伏擊他的宗教裁判庭的人。經由下水道甩掉追兵之後，艾吉奧遇到了自稱身為刺客的拉斐爾·桑切斯。拉斐爾把一名被捕刺客的下落告訴了艾吉奧，請求他的幫助。艾吉奧立刻趕了過去。就在那名刺客將被宗教裁判官處以火刑的時候，艾吉奧殺死了所有衛兵，將他救了下來。

艾吉奧回來之後，拉斐爾告訴他，受令抓捕刺客的是加斯帕爾·馬丁內斯，他聽命於託爾克馬達。艾吉奧很快便打探到了加斯帕爾的下落，發現他正和託爾克馬達以及衛兵一起圍堵一名刺客。託爾克馬達向那名被圍的刺客坦白道，正是羅德里戈·博吉亞命令他下令抓捕這些「沒有信仰的」西班牙刺客。艾吉奧也將他說的話聽在耳裡。那名刺客喪命於衛兵手下之後，加斯帕爾等人散開，加斯帕爾身邊不再有守衛了。艾吉奧隨後來到加斯帕爾面前，質問加斯帕爾是否知道聖殿騎士，但加斯帕爾矢口否認，表示聖殿騎士「早在兩個世紀以前就已經完蛋了」。面對著艾吉奧的刀刃，他陷入了沉默，於是艾吉奧轉而向他討要被捕的六名刺客的名字。救下其中一人之後，艾吉奧帶著那名刺客回去找到了拉斐爾，把這些名字告訴了拉斐爾。不過，剩下的五名刺客都在薩拉戈薩。旋即來到薩拉戈薩之後，拉斐爾叫艾吉奧去找宗教裁判庭的法官佩德羅·略倫特。這位法官的法庭設立在鎮子的另一頭。抵達之後，艾吉奧發現託爾克馬達也在場。一名刺客正遭受審判，他因拒絕皈依並懺悔而被處死。艾吉奧偷聽到了隨後進行的對話，立刻去尋找那五名刺客。其中，有四名刺客被關押在陵墓中，剩下的那一名刺客則被關在教堂裡。將這些刺客一一救出之後，艾吉奧殺死了佩德羅·略倫特。

回到拉斐爾處後，艾吉奧問拉斐爾，自己是否可以返回義大利。但是拉斐爾還需要他提供幫助，抵抗格拉納達的宗教裁判庭人員。艾吉奧答應了，刺殺了格拉納達城裡的一名聖殿騎士特務，還發現路易斯·聖坦傑爾其實也是一名刺客。

艾吉奧再次計畫返回義大利，但遭到了聖殿騎士的阻撓。他被迫保護路易斯，擊退聖殿騎士。然後，他得知，拉斐爾也不幸被捕。艾吉奧為了救出拉斐爾而一路奮戰，潛入了託爾克馬達的堡壘。在與託爾克馬達進行一番簡單對話之後，託爾克馬達關上了面前的大門，阻止了想要刺殺他的艾吉奧。最後艾吉奧回去和拉斐爾、路易斯碰頭，表示自己並不認為託爾克馬達本身是一名聖殿騎士，他只是被羅德里戈·博吉亞荒謬的說法迷惑了而已。最後，艾吉奧離開了西班牙，回到了義大利，繼續他追回伊甸蘋果的旅程。臨行前他告訴路易斯和拉斐爾，若是哥倫布發現新大陸歸來，一定要告訴他。